Địa bàn phường Nguyễn Du hiện nay trước đây vốn là phường Nguyễn Du, phường Bùi Thị Xuân và một phần phường Ngô Thì Nhậm thuộc quận Hai Bà Trưng.

Trước khi sáp nhập, phường Nguyễn Du có diện tích 0,37 km², dân số là 6.268 người, mật độ dân số đạt 16.941 người/km². Phường Bùi Thị Xuân có diện tích 0,14 km², dân số là 4.489 người, mật độ dân số đạt 32.064 người/km².

Ngày 11 tháng 2 năm 2020, sáp nhập toàn bộ diện tích và dân số của phường Bùi Thị Xuân cùng 0,01 km2 diện tích tự nhiên và 642 người của phường Ngô Thì Nhậm vừa giải thể (mặt phố Huế từ số nhà 52 đến số nhà 214) vào phường Nguyễn Du.[1]